Taman Nasional Alas Purwo mempunyai keanekaragaman jenis aves yang cukup tinggi berdasarkan survei yang sudah dilakukan dan beberapa penelitian yang telah dilakukan di berbagai tipe habitat (Hutan Mangrove, Savana, Hutan Tanaman, Hutan Pantai dan Hutan Dataran Rendah) yang ada di kawasan TN Alas Purwo. Sampai tahun 2020 tercatat ditemukan lebih dari 250 jenis yang teridentifikasi. Beberapa jenis burung yang sering dijumpai diantaranya Elang Laut Perut Putih (Haliaeetus leucogaster), Elang Ular Bido (Spilornis cheela), Ayam Hutan Hijau (Galus varius), Ayam Hutan Merah (Gallus gallus), Kuntul Kecil (Egreta garzeta), Rangkong Badak (Buceros rhinoceros), Merak Hijau Jawa (Pavo muticus muticus), Dara Laut Jambul (Sterna bergii) dan Cekakak Jawa (Halcyon cyanoventris).
Merak Hijau Jawa (Pavo muticus muticus) merupakan jenis aves yang menjadi primadona dan dapat dijumpai dengan mudah di kawasan. Aktivitas merak sangat menarik untuk diamati, terutama saat mereka kawin. Keberadaanya mudah dijumpai dari mulai pintu masuk Rowobendo, Feeding Ground Sadengan dan sepanjang jalan menuju Ngagelan.
Alas Purwo merupakan salah satu wilayah penting di jawa dalam proses migrasi burung dari daratan asia menuju Australia, atau yang dikenal dengan jalur terbang Asia Timur – Australasia. Biasanya kelompok burung migran ini datang dari arah barat dan berada di daerah-dareah sekitar pantai selatan di taman nasional pada bulan September-November tiap tahunnya, sebelum mereka melanjutkan perjalanannya ke arah timur.
